Dataset for CDS herpesviridae of organism Panine gammaherpesvirus 1

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
***      *** * ** ***   ***    **** *       *** **  * *** *                     
ATG------GCCtAtTCtACA---GATttcgTGTTtG-------CCCtGTgtAtGCGtGg--------------------
   aggcca   g g  a   agg   acac    a tgaggac   g  cg g   g agtcgcgccgtcgccgccgga

        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                  *** ***     ** ** ** **        ** *  * *****    **  * * * *** 
------------------CAGtTAC-----GTtCAtGGcAA--------TGtAtgCtGTGTT----CTcgCgGgAtGAGt
cgacaaggtggccgagtc   c   ctcat  g  g  a  tggatctt  c cc g     ggag  ac a c a   a

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
   **** *   ** * **      * * *****     ** * *  *    *  **  ** ***  *   ***   * *
cggACCTgC---CGtTtCCggcggcGgTcCTGTG--tttGCtGtTccAtttgTtgCTtgAGgAGGtcAttcAGCtgtAtG
aac    c tcg  c g  ccacaa a a     gtccg  g a aa ggcc cc  ga  a   aa gaa   aaa c 

       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
* **          ** **  **  ******     **  * * *  *****          *** *  *  *** ****
CgGAgttgttttgcAAgAC--GGggGACATTtgtggCAggCgC-GctCACGT--------tgACCtGggTttTGC-CGCT
 a  accagccaca  c  tt  ca      gagaa  aa a t aa     ccagctcagc   a ca cc   g    

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
** *  ** **       *** * *   *    **    **  **   * * **  **    **  ****** ***    
GTgTttGAcGA------tCACtGtGgctAttggTC---tCTtgGGgtgGtGtTGtgCTggctGG--TGGTGTtTGCgt--
  a ac  a  tatattc   c c aag ccca  gcgc  ca  cga c c  gc  acac  cc      a   aggc

       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 ***   **    ** * ** * *****                *** * *  **  *  * ***   * *    * *  
-TGCgggACtttgTGgAtGAcC-CAGAA----------------GTGgAgCttTCgtTttGtGGGctgTtGgccgCtA--
c   aaa  aacc  c g  a a     cactccttactatgtt   c c cg  ag cc g   aca c caaa c cc

       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  **   *  * * *  **  * **    *  * *** ***  * *  *     * **  ** * *  *  *        
--GCgctGtcCtGgAtgCTttGgTTtgtgAggA-GGGtGGCttGcCtgGtttgcTtAGgcGCgAgTttCttG--------
tg  caa ga c c ga  cg a  cacc ac t   c   ag a aa accaa g  aa  c c cc cc gctccaca

       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
      * **** *  **      ***** *****   ** *   * ** * * ****                      
----ttAgATGGgCttTG------GCCGGcCTGAC--tGAgTttgTtAAtTgTtTGTAg---------------------
aactcg c    a ga  cttttt     a     ttc  c ccc g  a c a    actatttatttatctctagagg

       650
....:....|
          
----------
aagacactaa
© 1998-2018