Dataset for CDS BAD of organism Astyanax mexicanus

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
***     **   * * ** * * * * ** * *        *  ******                             
ATG-----TCcgtAtCtGCtAgAgCtGcGGcGgG-------tActTGCGAC-----------------------------
   agcaa  aac g g  g a a g a  a a ctcgtttg ac      gaggagggatatagccaagcacttaacag

        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
       ** ****                      * **** *    ** *   ** **             * *****
-------TCgACTG---------------------tTtTCAGgCcgttGTgC--gAAtTC-------------GtTTTCA
cagaaca  c    aaggaggggggagagatacgcc g    c aacc  c tga  c  atctggaagcaca a     

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
******          * ****  **  * ** **   ** ****    *****     ** **   * *    ***** 
CAATGG----------AtCACAt-GTtcAgAAtATgtgATgAGTC----AGATGcctctGAtGAgttAgGgtggTCAGA-
      aaaagacacc c    ca  aa c  g  cac  c    ccat     aacac  a  acc a agac     g

       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 *** **   **            ***   ****** *  *** *  *  * ***   *******         ***** 
gCAGtCAgggGT------------CAGtcgGACAGCtGggCCAtCgtGttCtGGG--gCACATCA---------CTGTT-
c   c  aaa  gtcgactcccca   aaa      g ac   g ac ga a   caa       tcagacgag     c

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 ****                      *********    **** *   *  *     ** *    **    * *  ** 
-GGAGg--------------------tACTCAGAGT----CCCAgGtgtAggA---ttTCtAtggcTGggggGgCtcTG-
c    atggggggtcgagtgaggctca         agag    a caa ca attca  a ccaa  aaaa a aa  a

       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
    *****   *** ***     * * ** * *** *   * ** ****   ******** ****   **  *******
----CAGGA---TGGtGCTtggggAgAgGAcGgTGGtGttgGtGAtGGAGcttCATTCCGAgGCCGctgCCggTCAGCTC
gaac     gtc   c   gcaac c c  a a   a ccc a  c    aac        c    aac  ac       

       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*  ** * ** ***  *************** ** *** ****** ****** ** **********   ** * **  **
CtgCTtCtCTgTGGgcAGCCAAGAAATATGGcCGgCAGtTGAGGAgGATGAGtGAtGAGTTTGACAcgtGGtTgGAgcAA
 cc  g g  a   aa               a  a   c      a      c  c          acg  c a  ca  

       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
***   * ****               ** ** *  ***    ** *** * *  **   * *****  * ** ** ***
GGGg--TtAAGA--------------gGAgCAgCtgGCC---gGAtGCAtAcCtcCCgcgGcTGGTTttCtTTtCTtTGG
   aac g    gggtgaggagtgcca  a  a cc   ctga  g   a a aa  caa a     cg c  c  c   

       650       660       670       680       690 
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|.
 **  *** ***         **** * * **            ***** *
gGTccCAAgGAA---------GAGGcGgGcAG------------AGAATgA
a  aa   a   tcagactct    a a a  cagccgtccagc     a 
© 1998-2019